怎么画边绑定图/circos图?


▴ Complex rearrangements of MLL in acute leukemias. These images are part of a poster that accompanies the publication of the MLL recombinome (C. Meyer et al., Leukemia 23, 1490 (Aug, 2009).

边绑定图/circos图是用来描述节点和边的关系的一种图,可以通过增加外圈的方式呈现丰富的信息。

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CPM-鲁棒的认知神经预测方法

CPM (connectome-based predictive modeling) 是近些年流行的神经影像分析方法之一。研究者通常借助CPM方法,探究某些认知特征背后的神经连接组模式。关于CPM的具体细节在Xilin Shen于2017年在nature protocol上发表文章中有详细阐述。以下为该文章的部分总结,可以供初学者了解。

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ROI 和 mask: 脑地图的操作——提取

ROI map就是在一个标准脑空间里的坐标,是我们做脑网络分析的常用手段。其数据是一个3D的矩阵,矩阵中大于0的值为ROI,当有多个ROI的时候,用不同的值来表示。

有时候我们不需要全部的ROI,比如,我们只想要默认网络的map,就可以在YEO或者其它的模板上抠出来。

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